　Moto2クラス、第17戦マレーシアを制したのはヨハン・ザルコ（AJO MOTORSPORT）。優勝で、Moto2クラスの連覇を決めた。

　セパン・インターナショナル・サーキットは、気温29℃、路面温度33℃。Moto3クラスの決勝が赤旗で終了した後に雨が降り出し、コンディションはウェットとなった。

　雨が強くなってきた中、スタートを決めたフランコ・モルビデリ（ESTRELLA GALICIA 0,0 MARC VDS）とジョナス・フォルガー（DYNAVOLT INTACT GP）がポールポジションのザルコを交わし、フォルガーがホールショットを奪った。モルビデリはすぐさまフォルガーを捉えてオーバーテイク。トップにモルビデリ、フォルガー、ザルコというトップ3となった。

　ポイントランキング2位で、ザルコの戴冠を阻止したいトーマス・ルティ（DERENDINGER INTERWETTEN）は8番手となった。中上貴晶（IDEMITSU HONDA TEAM ASIA）は1周目を終えて18番手だ。

　2周目、トップのモルビデリはペースが良く、フォルガーはこれについてこられない。ザルコはそのフォルガーを抜き、ファステストタイムを出してモルビデリを追撃する。

　サム・ロウズ（FEDERAL OIL GRESINI Moto2）、アクセル・ポンス（AGR TEAM）が転倒する中、トップ3のモルビデリ、ザルコ、フォルガーは等間隔での走行となっているが、4番手シメオン（QMMF RACING TEAM）はこれについていけず、およそ5秒離されている。

　残り15周という段階で、雨は止み、日が差してきた。

　3番手フォルガーから9秒離された、4番手集団は5台の争い。この集団の最後方にルティが含まれる。ザルコとは22ポイント差となっているランキング2位のルティ。この順位ではザルコがチャンピオンを確定させてしまうため、ルティにとっては絶望的な状況だ。

　雨が止んだことで、走行ライン上は水の量が少なくなり、白っぽく見えるようになったきた。どのライダーも無理はできない状況だが、レインタイヤをケアしているのか、モルビデリのペースが落ち、3台の間隔が接近してきた。

　残り6周の時点でザルコがモルビデリをオーバーテイクし、トップに浮上。ザルコは、1周で1秒以上の差をモルビデリにつける走りで、2番手以下を突き放しにかかった。

　残り4周で、モルビデリはバックストレートでフォルガーにも抜かれ3番手に。モルビデリも2コーナーで抜き返すが、4コーナーで再びフォルガーが前に立った。

　ザルコはファステストラップを連発し、残り2周で3秒以上のギャップを築き上げた。フォルガーはターン7でオーバーランし、再びモルビデリが2番手に浮上した。

　ザルコはそのままトップでチェッカー。優勝で自らのMoto2クラスのチャンピオン連覇に花を添えた。2位はモルビデリ。フォルガーはオーバーランしたミスを取り戻せず、3位となった。

　ランキング2位のルティは6位でフィニッシュ。ザルコを止めることはできなかった。

　複雑なコンディションで、追い上げをすることができなかった中上は、21位フィニッシュに終わっている。

Moto2 2016 マレーシア決勝結果

Cla		#	Driver	Bike	Laps	Time	Gap	Interval	km/h	Retirement	Points
1		5	Johann Zarco	Kalex	19	45'51.036			137.8		25
2		21	Franco Morbidelli	Kalex	19	45'54.292	3.256	3.256	137.6		20
3		94	Jonas Folger	Kalex	19	45'54.725	3.689	0.433	137.6		16
4		7	Lorenzo Baldassarri	Kalex	19	46'12.464	21.428	17.739	136.7		13
5		55	Hafizh Syahrin	Kalex	19	46'15.736	24.700	3.272	136.5		11
6		12	Thomas Luthi	Kalex	19	46'17.220	26.184	1.484	136.5		10
7		73	Alex Marquez	Kalex	19	46'19.213	28.177	1.993	136.4		9
8		97	Xavi Vierge	Tech 3	19	46'19.891	28.855	0.678	136.3		8
9		10	Luca Marini	Kalex	19	46'20.283	29.247	0.392	136.3		7
10		32	Isaac Viñales	Tech 3	19	46'21.005	29.969	0.722	136.3		6
11		24	Simone Corsi	Speed Up	19	46'21.902	30.866	0.897	136.2		5
12		93	Ramdan Rosli	Kalex	19	46'22.296	31.260	0.394	136.2		4
13		87	Remy Gardner	Kalex	19	46'22.829	31.793	0.533	136.2		3
14		40	Alex Rins	Kalex	19	46'25.733	34.697	2.904	136.1		2
15		19	Xavier Simeon	Speed Up	19	46'37.705	46.669	11.972	135.5		1
16		2	Jesko Raffin	Kalex	19	46'40.162	49.126	2.457	135.3
17		11	Sandro Cortese	Kalex	19	46'40.329	49.293	0.167	135.3
18		52	Danny Kent	Kalex	19	46'42.646	51.610	2.317	135.2
19		57	Edgar Pons	Kalex	19	46'45.985	54.949	3.339	135.1
20		23	Marcel Schrötter	Kalex	19	46'46.497	55.461	0.512	135.0
21		30	Takaaki Nakagami	Kalex	19	46'59.649	1'08.613	13.152	134.4
22		27	Iker Lecuona	Kalex	19	47'07.610	1'16.574	7.961	134.0
23		54	Mattia Pasini	Kalex	19	47'16.874	1'25.838	9.264	133.6
24		14	Ratthapark Wilairot	Kalex	19	47'52.671	2'01.635	35.797	131.9
	dnf	20	Alessandro Nocco	Kalex	12	30'26.404	7 laps	7 laps	131.1	Retirement
	dnf	70	Robin Mulhauser	Kalex	5	12'42.967	14 laps	7 laps	130.7	Retirement
	dnf	49	Axel Pons	Kalex	1	2'32.852	18 laps	4 laps	130.5	Accident
	dnf	22	Sam Lowes	Kalex	1	2'35.544	18 laps	2.692	128.2	Accident